Чтобы открыть папку от имени root в файловом менеджере grapical, выполните следующую команду:
gksu nautilus /etc/apt/
Если вы хотите выполнять свои операции из командной строки, следующая команда вводит указанный каталог и делает вас root. Тем не менее, вам было бы лучше использовать первый метод, описанный выше.
cd /etc/apt; sudo -i