На моем языке есть поговорка, которую можно примерно перевести как "Вы не можете превратить фарш обратно в мясо, вращая ручку мясорубки в противоположном направлении".; 
:)
Процедура обновления односторонняя - при установке новых версий программного обеспечения ваши конфигурационные файлы и настройки изменяются сценариями после установки пакетов для использования нового формата, который требуется для нового программного обеспечения. В принципе, нет противоположной процедуры - сделать новый конфигурационный файл совместимым со старым программным обеспечением.