Может быть что-то вроде
find . -type f | wc -l
это сделало бы свое дело. Попробуйте выполнить команду из родительской папки.
find . -name <pattern> -type f находит все fиль в . и вложенные папки. Результат (список найденных файлов) передается (|) к wc -l который подсчитывает количество lинес. -name <pattern> ищет только определенные файлы.