вы могли бы просто отключить его с помощью:
sudo update-rc.d apache2 disable
а затем, если вы хотите включить его снова:
sudo update-rc.d apache2 enable
в зависимости от проекта, над которым я работаю, удобно иметь удобный доступ к сервису, если я захочу его повторно включить.