Если вы установили его из репозиториев Ubuntu, это
sudo apt-get purge phpmyadmin"Очистка" вместо "удалить" предписывает ему также удалить свои конфигурационные файлы, включая конфигурацию, которую он добавил в каталоги конфигурации Apache.
Вам может быть предложено указать, хотите ли вы также удалить его базу данных. Это приведет к удалению специфичной для phpMyAdmin базы данных с вашего сервера MySQL. Это не повредит серверу MySQL. В вашем случае выберите Да. Если вам не будет предложено сделать это, вам нужно будет удалить его базу данных вручную.
Если вы установили его вручную, извлекая файлы в каталог веб-сервера, просто удалите все эти файлы и удалите его базу данных с вашего сервера MySQL, предполагая, что вы зашли так далеко в установке.