Оказывается, пакеты из официальных репозиториев делают свое дело. Просто установите exfat-utils и exfat-fuse пакеты с помощью менеджера пакетов по вашему выбору или просто с помощью apt-get из командной строки:
sudo apt-get install exfat-utils exfat-fuseЭто должно обеспечить рабочую файловую систему exfat (поддержка чтения и записи, но не форматирование дисков с помощью exfat через Gnome Disks и GParted).
Начиная с 13.04+ в этом не было необходимости, но если вы используете 12.04, вы вероятно необходимо перезагрузить компьютер, прежде чем вы сможете смонтировать раздел exfat. Если после установки пакетов у вас это не работает, попробуйте перезагрузиться.